湯宿温泉の真田家とのつながりは深く、
初代沼田城主真田信幸が関が原の合戦の後、湯宿温泉で疲れを癒したとされ、
また五代城主の信直は痔の持病がここで根治したので、
裏山に薬師如来堂を建立したとされています。
当館は、この薬師如来堂から名を受け、「薬師の湯」と呼ばれています。